Вторая мировая война
С 21 октября 1939 года — командующий надводным флотом. Считался крупнейшим авторитетом в области тактики крейсерских операций, проявил себя самостоятельным командиром.
В ноябре 1939 года вывел «Шарнхорст» и «Гнейзенау» в Северное море, имея целью прикрыть возвращение линейного корабля «Дойчланд» после рейда в Атлантику. Маневр удался, и «Дойчланд» без происшествий вернулся на базу. При этом он уклонился от боя с превосходящими силами английского флота. После этого случая у Маршалла испортились отношения с Эрихом Редером.
Руководил германским флотом во время захвата Норвегии. Одержал крупную победу в бою с кораблями английского конвоя близ Нарвика 8 июня 1940 года, потопив авианосец «Глориес» и два эсминца сопровождения. Однако после кампании Редер вновь стал обвинять Маршалла в неисполнении приказов ОКМ, и 18 июня 1940 года заменил последнего адмиралом Гюнтером Лютьенсом.
С 26 августа 1940 года инспектор военно-морских учебных заведений. С конца 1941 выполнял особые поручения в группах ВМС «Юг» и «Восток».
В апреле — мае 1942 года начальник военно-морской станции «Остзее». С 12 августа 1942 года Маршаллу были подчинены ВМС, базировавшиеся на территории Франции. А в конце сентября он поставлен во главе командования ВМС «Запад» (штаб — Париж) и одновременно командующий адмирал во Франции.
19 апреля 1943 года заменен адмиралом Теодором Кранке, а 30 июня 1943 года вновь уволен в отставку.
Затем с 4 июня 1944 года руководил особым штабом ВМС на Дунае, но 30 ноября 1944 года снова уволен в отставку.
С 19 апреля 1945 года — руководитель Командования ВМС «Запад».
8 мая 1945 года арестован американскими войсками и содержался в лагере для военнопленных. 25 июня 1946 года освобожден.
Награды
Железный крест (1914) 2-го класса
Железный крест (1914) 1-го класса
Рыцарский крест Королевского ордена дома Гогенцоллернов с мечами (Пруссия)
Орден «Pour le Mérite» (4 июля 1918) (Пруссия)
Нагрудный знак подводника (1918)
Баварский орден «За военные заслуги» 4-го класса с мечами
Орден Железной короны 3-го класса
Орден «За военные заслуги» 3-го класса (Австро-Венгрия)
Медаль «Галлиполийская звезда» (Османская империя)
Пряжка к Железному кресту 2-го класса
Пряжка к Железному кресту 1-го класса
Немецкий крест в золоте (23 марта 1942)