Департамент информационно-аналитического обеспечения (ДІАЗ-укр.)
Департамент контрразведки (ДКР)
Департамент контрразведывательной защиты экономики государства (ДКЗЕД-укр.)
Департамент защиты национальной государственности (ДЗНД-укр.)
Департамент оперативно-технических мероприятий (ДОТЗ-укр.)
Департамент оперативного документирования (ДОД)
Департамент охраны государственной тайны и лицензирования (ДОДТЛ-укр.)
Департамент хозяйственного обеспечения (ДГЗ-укр.)
Главное управление по борьбе с коррупцией и организованной преступностью (ГУ «К», ГУБКОЗ-укр.) (на правах департамента)
Главное следственное управление (ГСУ)
Центр специальных операций борьбы с терроризмом, защиты участников уголовного судопроизводства и работников правоохранительных органов (ЦСО «А») (на правах департамента)
Управление внутренней безопасности (УВБ)
Главная инспекция
Управление обеспечения специального оперативного учета (УЗСОО-укр.)
Управление работы с личным составом (УРОС-укр.)
Управление правового обеспечения (УПЗ-укр.)
Управление специальной связи (УСЗ-укр.)
Военно-медицинское управление (ВМУ)
Служба мобилизации и территориальной обороны (СМТО)
Финансово-экономическое управление (ФЕУ-укр.)
Управление режима, документального обеспечения и контроля (УРДЗК-укр.)
Контрольно-ревизионная инспекция
Отдел обеспечения досудебного следствия (ВЗДС-укр.) - изолятор временного содержания Центрального управления СБУ (Киев); сектор Отдела в Одесской обл. - изолятор временного содержания при УСБУ в Одесской обл; сектор Отдела в Донецкой обл. - изолятор временного содержания при УСБУ в Донецкой обл.
2. Региональные органы
Главное управление Службы безопасности Украины в АР Крым
Управление Службы безопасности Украины в городе Киеве
Управление Службы безопасности Украины в Киевской области
Управление Службы безопасности Украины в Винницкой области
Управление Службы безопасности Украины в Волынской области
Управление Службы безопасности Украины в Днепропетровской области
Управление Службы безопасности Украины в Донецкой области
Управление Службы безопасности Украины в Житомирской области
Управление Службы безопасности Украины в Закарпатской области
Управление Службы безопасности Украины в Запорожской области
Управление Службы безопасности Украины в Ивано-Франковской области
Управление Службы безопасности Украины в Кировоградской области
Управление Службы безопасности Украины в Луганской области
Управление Службы безопасности Украины во Львовской области
Управление Службы безопасности Украины в Николаевской области
Управление Службы безопасности Украины в Одесской области
Управление Службы безопасности Украины Полтавской области
Управление Службы безопасности Украины в Ровенской области
Управление Службы безопасности Украины в Сумской области
Управление Службы безопасности Украины в Тернопольской области
Управление Службы безопасности Украины в Харьковской области
Управление Службы безопасности Украины в Херсонской области
Управление Службы безопасности Украины в Хмельницкой области
Управление Службы безопасности Украины в Черкасской области
Управление Службы безопасности Украины в Черновицкой области
Управление Службы безопасности Украины в Черниговской области
Управление Службы безопасности Украины в городе Севастополе.
3.Органы военной контрразведки (Управление военной контрразведки Департамента контрразведки)
4. Учебные, научные, научно-исследовательские, и другие учреждения, организации и предприятия:
Национальная академия Службы безопасности Украины (НАСБУ-укр.);
Институт подготовки юридических кадров для Службы безопасности Украины Национального Университета "Юридическая Академия Украины" им. Ярослава Мудрого (ІПЮКдляСБУ-укр.).
Отраслевой государственный архив.
Украинский научно-исследовательский институт специальной техники и судебных экспертиз Службы безопасности Украины (ІСТЕ-укр.) .
Другие учреждения, организации, предприятия.
5. Антитеррористический центр при Службе безопасности Украины (АТЦ).
Руководство СБ Украины
Председатель СБ Украины — генерал армии Украины Хорошковский Валерий Иванович
Первый заместитель Председателя — генерал-лейтенант Химей Владимир Васильевич
Первый заместитель Председателя — начальник Главного управления по борьбе с коррупцией и организованной преступностью — генерал-лейтенант Рокитский Владимир Георгиевич
Заместитель Председателя — генерал-лейтенант Породько Владимир Михайлович
Руководители СБУ
Эмблема Управления по борьбе с коррупцией СБУ по Харьковской области
Ноябрь 1991 — июль 1994 — Генерал армии Украины Евгений Марчук
Июль 1994 — июль 1995 — Валерий Маликов
Июль 1995 — апрель 1998 — Генерал армии Украины Владимир Радченко
Апрель 1998 — февраль 2001 — Генерал армии Украины Леонид Деркач
Февраль 2001 — сентябрь 2003 — Генерал армии Украины Владимир Радченко
Сентябрь 2003 — февраль 2005 — Игорь Смешко
Февраль 2005 — сентябрь 2005 — Александр Турчинов
Сентябрь 2005 — декабрь 2006 — Генерал армии Украины Игорь Дрижчаный
Декабрь 2006 — март 2009 — исполняющий обязанности главы СБУ Валентин Наливайченко
