После падения режима Саддама Хусейна Химический Али предстал перед Специальным иракским трибуналом вместе со свергнутым президентом и однопартийцами. Али Хасан аль-Маджид был обвинен иракским трибуналом (председатель — курд) в военных преступлениях и преступлениях против человечности, в частности, в геноциде курдов. На первом заседании суда по делу об операции Анфаль Химический Али отказался сотрудничать с трибуналом, заявив «я буду хранить молчание». На судебных заседаниях аль-Маджид держался также независимо, как и Саддам. В суде «Химический Али» заявлял, что не считает свои действия ошибочными, и отмечал, что правительственная кампания была направлена против курдов не из-за их этнической принадлежности, а из-за попыток последних расколоть целостность Ирака.
24 июня 2007 года иракский трибунал приговорил Али Хасана аль-Маджида к смертной казни через повешение. Во время оглашения приговора он стоял неподвижно, не реагируя, в то время как остальные подсудимые, услышав вердикт, начали протестовать. 4 сентября Апелляционный суд Ирака поддержал в отношении Али аль-Маджида обвинительный вердикт Верховного трибунала, но казнь отложили до окончания священного месяца поста рамадан 13 октября, а после окончания праздника приведению приговора в исполнение помешали разногласия между премьер-министром Нури аль-Малики с одной стороны, президентом Ирака Джалялем Талабани и его заместителем Тариком аль-Хашими — с другой. Несмотря на это 29 февраля 2008 года президентский совет Ирака утвердил смертный приговор Али Хасану аль-Маджиду, но он так и не был приведен в исполнение.
17 января 2010 года аль-Маджид в четвёртый раз был приговорён к смертной казни по делу «Анфаль».
Процесс «Интифада Шаабания»
21 августа 2007 года начался новый судебный процесс. Иракский трибунал рассматривал события, связанные с подавлением восстания шиитов на юге Ирака в 1991 году. Аль-Маджид с 14 соратниками Саддама Хусейна вновь предстал перед судом и снова не признал себя виновным. Свидетели рассказывали, что во время подавления восстания людей сбрасывали с вертолётов.
2 декабря 2008 года иракский трибунал во второй раз приговорил Али Хасана аль-Маджида к смертной казни через повешение. Во время оглашения приговора аль-Маджид сохранял спокойствие
В марте 2009 г. Маджиду был вынесен третий смертный приговор за казни шиитских торговцев-"спекулянтов" в 1999 году, 17 января 2010 г. - четвертый за газовую бомбардировку Халабджи и "Анфаль" в целом". Спустя 8 дней он был казнен.
Казнь
В понедельник 25 января 2010 года Али Хасан аль-Маджид был повешен в багдадской тюрьме.
